急性腹瀉按發病原因可分為感染性腹瀉和非感染性腹瀉兩大類。
(一)感染性腹瀉包括
(1)病毒感染：如輪狀病毒、柯薩奇病毒所引起的腹瀉。
(2)細菌感染：如痢疾桿菌、沙門氏菌屬、副溶血弧菌、金黃色葡萄球菌等感染所引起的腹瀉及潰瘍性結腸炎等。
(3)真菌感染：如腸念珠菌病。
(4)寄生蟲感染：如急性阿米巴腸病、血吸蟲病、梨形鞭毛蟲病。
(二)非感染性腹瀉包括
(1)化學品和藥物所致的腹瀉：如砷、汞、磷中毒，使用導瀉劑及擬副交感神經的藥物(硫酸鎂、新斯的明等)。
(2)食物中毒：毒蕈中毒、河豚魚中毒等所引起的腹瀉。
(3)腸道變應性病：如對某些食物過敏所致的腹瀉，以乳制品和魚蝦類最多見。
(4)全身性疾病教口糖尿病、尿毒癥、甲狀腺危象、過敏性紫癜所引起的腹瀉。
(5)功能性腹瀉：如腸道易激綜合征、精神緊張、情緒激動所引起的情緒性腹瀉。
