新生兒可在頸前、腋下、口腔或肛門處測體溫，后兩者測得體溫較準確，但頸前或腋下更方便、安全。頸前或腋下體溫正常范圍為36～37℃，而口腔、肛門處則為36．5～37．5℃。口測、肛測不易操作，需一定技巧性，如口腔測體溫要求溫度計潔凈，最好是舌下含著體溫計的水銀球部分，肛測前要在水銀球部位涂少許凡士林，緩慢插入1.5～3cm左右。口測或肛測的整個過程要盡量使寶寶保持安靜，以免發生意外。
當感覺新生兒發熱時，把溫度計(最好嬰兒專用型)水銀柱甩到35℃以下，將水銀球一頭夾在新生兒頸前或腋下皮膚皺褶處，盡量使水銀球都被皮膚接觸并包裹，夾3～5分鐘左右后取出并讀數，讀數前不要用力甩動溫度計，以免影響結果準確性。
新生兒哭鬧、進食熱奶或水、洗澡后，體溫都會較平時高；午后或晚上體溫也比清晨高；環境溫度很高時也會導致體溫增高；有時感染很重體溫反而很低。總之，不能只靠體溫來判斷病情，要綜合精神狀態、食欲及其他臨床表現。
