發育遲緩兒童除了有在智能及運動發育遲緩，、學習困難、，語言障礙等癥狀外、尚常伴有其他醫療問題。
1、 神經系統：
首先在神經系統方面最常見是癲癇。因造成發育遲緩原因不同、而有不同之比例合并癲癇。如腦性麻痹中的spastic hemiplegic type之機率為 34-60%， quadriplegic type 為50-90%， diplegics type為16-27%，dyskinetic type 為23-26%。一般而言、發育遲緩之程度越嚴重，合并癲癇之機率相對增加且難治療。
癲癇之治療以藥物為主、隨癲癇型式而選擇抗癲癇藥物（anti-epileptic drug， 以下簡稱 AED）。藥物治療原則為由單一AED、由小量漸增、直到血液中AED濃度達治療范圍。如藥效不佳、則考慮換成或添加第二個AED。難控制之癲癇常需服用兩種以上之AED。服藥期間必須定期追蹤、包括藥物濃度、副作用之監測。如能完全控制2年且腦波恢復正常者、可在醫師指導下嘗試減藥。如腦波仍異常、則建議多服用一年再嘗試減藥。減藥成功之機會受病因、病情之影響，有些病患需終身服藥。嚴重之癲癇病患、可結受外科作腦葉切除（如lobectomy）、分割（如corpus callotomy）之腦部手術治療，或是刺激迷走神經（vagal nerve stimulation）來達到減輕病況。
發育遲緩的病童之眼睛較常有斜弱視、白內障、視網膜病變。其耳部有中耳炎、中耳積水或聽力有障礙機率亦較常人增加。所以需請相關醫師作檢查以期早期治療。
2、呼吸系統：
這些病人常因吞咽困難、易有嗆入性肺炎。且因長期臥床及咳痰無力等因素而有肺炎之發生。值得注意的是這些病人之致病細菌異于一般正常人之居家感染（community-acquired）之病菌、且常是mixed infection， 或是合并厭氧性細菌。選擇始用之抗生素時要考慮這些情況之可能。另外、也要給予姿勢引流（postural drainage）；有些病患甚至需要氣管切開造口術（tracheostomy）來維持氣道通暢。這些病患之肺炎、常因較嚴重、引發肺膿瘍機率相對增加、有需要時要作電腦斷層檢查作鑒別診斷。 3。腸胃道系統與營養方面問題：
發育遲緩嬰孩常有喂食困難，包括吞咽障礙、易嗆、易嘔吐、不會咀嚼、吞咽緩慢、喂食時間長。因而造成營養不良及易得吸入性肺炎。解決的方法有依情況用鼻胃管灌食、少量多餐、吞咽訓練、嚴重者需胃造口（gastrostomy）供長期喂食。反之，有些孩童進食過量造成肥胖。至于排泄方面常有習慣性便秘、宜早期注意添加高纖維性食物及作排便訓練。另外口腔牙齒清潔保健亦宜早期注意、以預防牙周病及dental caries之發生。
4、泌尿及骨骼系統：
最常見有小便失禁、尿道感染。尤其在脊髓神經異常病患要特別注意及長期治療、以避免腎衰竭。且因神經肌肉問題而有骨骼畸形、關節僵直或變形，均要早期預防及矯正。
